Gene | Input weight | Standard | Rank | |
NEUROD1 | - | -1 | 127 | |
SATB2 | 0.25 | 1 | 149 | |
FGFR2 | - | -1 | 237 | |
PLXNA2 | - | - | 243 | |
APC | 0.25 | 1 | 266 | |
LRP6 | - | - | 279 | |
BMPR2 | - | -1 | 281 | |
HIPK1 | - | - | 311 | |
PPP3R1 | - | - | 321 | |
MLLT3 | - | - | 383 | |
SFRP1 | - | - | 387 | |
CELSR2 | - | - | 410 | |
ASCL1 | - | - | 413 | |
YY1 | - | - | 419 | |
FOXP1 | 1.0 | 1 | 435 | |
PBX1 | - | - | 489 | |
PCDH8 | - | - | 531 | |
PAX6 | 0.25 | 1 | 544 | |
RELN | 1.0 | 1 | 626 | |
FOXN3 | - | - | 647 | |
PAX2 | - | - | 653 | |
LHX2 | - | - | 655 | |
FOXG1 | - | - | 661 | |
PGAP1 | - | - | 711 | |
FOXJ3 | - | - | 756 | |
PBX3 | - | - | 773 | |
ZIC3 | - | -1 | 789 | |
SMAD4 | - | - | 821 | |
SMAD3 | - | - | 823 | |
DLL3 | - | -1 | 847 | |
FOXJ2 | - | - | 902 | |
ZIC1 | - | - | 939 | |
CHRD | - | - | 941 | |
ACVR2A | - | - | 965 | |
PTCH1 | - | -1 | 972 | |
SMAD5 | - | - | 1002 | |
PCSK6 | - | - | 1035 | |
HIPK2 | - | - | 1051 | |
FOXO3 | - | - | 1056 | |
HIF1A | - | - | 1075 | |
NKX2-2 | - | - | 1120 | |
BMP7 | - | - | 1137 | |
BMPR1A | - | - | 1140 | |
MIB1 | 0.25 | 1 | 1153 | |
HOXD3 | - | - | 1195 | |
PCGF2 | - | - | 1217 | |
MEOX2 | - | - | 1224 | |
FEZF2 | 0.25 | 1 | 1366 | |
SEMA5A | 0.5 | 1 | 1388 | |
HOXD4 | - | - | 1445 | |
CXXC4 | - | - | 1490 | |
LEF1 | - | - | 1499 | |
LRP4 | - | - | 1500 | |
WNT10B | - | - | 1517 | |
RFX3 | - | - | 1523 | |
WNT2B | - | - | 1673 | |
ACVR2B | - | -1 | 1676 | |
CYP26B1 | - | - | 1734 | |
FOXF2 | - | - | 1787 | |
VANGL2 | - | - | 1793 | |
SMAD1 | - | - | 1872 | |
OTX2 | - | -1 | 1916 | |
FOXA1 | - | - | 1990 | |
DLL1 | - | - | 2053 | |
HOXB8 | - | - | 2234 | |
MID1 | - | - | 2259 | |
HOXB5 | - | - | 2288 | |
BCOR | - | -1 | 2290 | |
WNT2 | 0.25 | 1 | 2299 | |
SMAD6 | - | - | 2305 | |
BMPR1B | - | -1 | 2316 | |
EPB41L5 | - | - | 2335 | |
DLX2 | 0.25 | 1 | 2357 | |
DLX1 | 0.25 | 1 | 2400 | |
DUSP6 | - | - | 2466 | |
SIX3 | - | -1 | 2494 | |
FOXK2 | - | - | 2514 | |
LHX1 | - | - | 2560 | |
DSCAML1 | - | - | 2579 | |
EMX1 | - | - | 2613 | |
TSHZ1 | - | - | 2619 | |
NKX3-2 | - | - | 2620 | |
FOXA2 | - | - | 2645 | |
CITED2 | - | - | 2650 | |
SMAD2 | - | - | 2694 | |
TULP3 | - | - | 2770 | |
HHIP | - | - | 2786 | |
NRP1 | - | - | 2807 | |
NFATC3 | - | - | 2813 | |
TBX5 | - | - | 2836 | |
SRF | - | - | 2841 | |
HOXD9 | - | - | 2856 | |
NOTCH1 | - | -1 | 2865 | |
SKI | - | - | 2904 | |
SIM2 | - | - | 2910 | |
NR2F2 | - | - | 2941 | |
TBX3 | - | - | 2958 | |
C2CD3 | - | - | 2994 | |
SOSTDC1 | - | - | 3003 | |
CYP26A1 | - | - | 3009 | |
FOXD3 | - | - | 3025 | |
CITED1 | - | - | 3064 | |
NODAL | - | -1 | 3149 | |
CRKL | - | - | 3156 | |
HEY2 | - | - | 3174 | |
TGIF1 | - | -1 | 3264 | |
FOXN2 | - | - | 3284 | |
T | - | - | 3286 | |
BMI1 | - | - | 3300 | |
WNT5A | - | - | 3319 | |
WNT8B | - | - | 3407 | |
HOXA7 | - | - | 3411 | |
HOXA3 | - | - | 3427 | |
HOXC8 | - | - | 3439 | |
CDON | - | - | 3487 | |
FOXF1 | - | -1 | 3518 | |
VAX2 | - | - | 3553 | |
PAX7 | - | -1 | 3577 | |
HAND1 | - | - | 3590 | |
ATM | - | -1 | 3622 | |
FOXE3 | - | -1 | 3688 | |
SP8 | - | - | 3706 | |
ALDH1A2 | - | - | 3771 | |
EDNRA | - | -1 | 3857 | |
FOXE1 | - | -1 | 3900 | |
FOXO1 | 0.25 | 1 | 3947 | |
FLT1 | 0.25 | 1 | 3953 | |
IRX2 | - | - | 3967 | |
SOX17 | - | - | 4024 | |
CDX2 | - | - | 4071 | |
VEGFA | 0.25 | 1 | 4087 | |
GDF11 | - | - | 4104 | |
WNT16 | - | - | 4117 | |
NKX2-1 | - | - | 4142 | |
FOXP2 | 0.5 | 1 | 4163 | |
PBX2 | - | - | 4205 | |
RBM15 | - | - | 4247 | |
AXIN2 | - | -1 | 4260 | |
HOXA2 | - | - | 4273 | |
ALX3 | - | - | 4288 | |
RFNG | - | - | 4297 | |
WNT1 | - | - | 4383 | |
MYF6 | - | - | 4400 | |
AXIN1 | - | -1 | 4419 | |
HOXA11 | - | - | 4432 | |
GBX2 | - | - | 4440 | |
RAX | - | -1 | 4486 | |
FGF10 | - | -1 | 4532 | |
HOXD10 | - | - | 4534 | |
ALX1 | - | - | 4544 | |
LMX1B | 0.5 | 1 | 4551 | |
HOXB6 | - | - | 4560 | |
OTX1 | - | - | 4602 | |
WNT3 | - | - | 4613 | |
NKX6-1 | - | - | 4665 | |
WNT3A | - | - | 4747 | |
NKX6-2 | - | - | 4791 | |
NKX3-1 | - | - | 4793 | |
KIF3B | - | - | 4833 | |
HOXD13 | 0.25 | 1 | 4997 | |
EN1 | - | - | 5021 | |
HOXD11 | 0.25 | 1 | 5105 | |
WNT6 | - | - | 5106 | |
HOXA5 | - | - | 5132 | |
SFRP2 | - | - | 5252 | |
FOXB1 | - | - | 5360 | |
NOG | - | -1 | 5439 | |
HOXC4 | - | - | 5536 | |
ARL6 | - | -1 | 5581 | |
HAND2 | - | - | 5589 | |
BMP5 | - | - | 5641 | |
FOXK1 | - | - | 5646 | |
CTNNBIP1 | - | - | 5675 | |
OSR1 | - | - | 5691 | |
MNX1 | - | - | 5812 | |
FOXQ1 | - | - | 5820 | |
CYP26C1 | - | - | 5830 | |
CDX4 | - | - | 5849 | |
HES1 | 0.25 | 1 | 5912 | |
ALX4 | - | - | 5932 | |
ACVR1 | - | -1 | 6054 | |
TDGF1 | - | - | 6132 | |
FOXD2 | - | - | 6176 | |
CELSR1 | - | - | 6180 | |
HOXC13 | - | - | 6219 | |
EGR2 | 0.25 | 1 | 6247 | |
GLI3 | - | -1 | 6261 | |
FOXL1 | - | - | 6313 | |
ZEB2 | - | - | 6361 | |
ABI1 | - | - | 6421 | |
BMP4 | - | -1 | 6499 | |
FOXI1 | - | -1 | 6510 | |
EFNB1 | - | -1 | 6517 | |
DVL2 | - | - | 6546 | |
BARX1 | - | - | 6608 | |
PAX8 | - | -1 | 6637 | |
CDX1 | - | - | 6685 | |
GAS1 | - | - | 6937 | |
CER1 | - | - | 6956 | |
HOXA6 | - | - | 7036 | |
WNT7B | - | - | 7113 | |
RTTN | - | - | 7129 | |
RNF2 | - | - | 7154 | |
IHH | - | -1 | 7160 | |
FRS2 | - | - | 7173 | |
TGFBR1 | - | -1 | 7268 | |
DNAH11 | - | -1 | 7284 | |
GLI2 | - | -1 | 7307 | |
WNT7A | - | - | 7312 | |
HOXD8 | - | - | 7316 | |
TDRD5 | - | - | 7375 | |
GRHL3 | - | - | 7409 | |
HES3 | - | - | 7466 | |
IRX3 | - | - | 7476 | |
CFC1 | - | -1 | 7488 | |
FOXL2 | - | -1 | 7521 | |
FOXJ1 | - | - | 7628 | |
RIPPLY2 | - | - | 7657 | |
SHROOM3 | - | - | 7745 | |
FOXN4 | - | - | 7786 | |
GRSF1 | - | - | 7797 | |
CXCL12 | - | - | 7802 | |
WNT8A | - | - | 7814 | |
WNT11 | - | - | 7820 | |
FOXD4L1 | - | - | 7836 | |
MYF5 | - | - | 7875 | |
FOXD1 | - | - | 7884 | |
LFNG | - | -1 | 7887 | |
WNT9B | - | - | 8217 | |
KDM2B | - | - | 8359 | |
GPC3 | - | -1 | 8430 | |
NKX2-5 | 0.25 | 1 | 8486 | |
RARG | 0.25 | 1 | 8575 | |
GSX2 | - | - | 8581 | |
ARC | 0.25 | 1 | 8587 | |
WNT10A | - | - | 8604 | |
PITX2 | - | -1 | 8708 | |
TBX20 | - | -1 | 8764 | |
RING1 | - | - | 8843 | |
IRX4 | - | - | 8883 | |
CTNNB1 | 0.5 | 1 | 9066 | |
LBX1 | - | - | 9134 | |
FOXN1 | - | - | 9284 | |
CCDC39 | - | - | 9326 | |
FOXO4 | - | - | 9362 | |
SUFU | - | -1 | 9372 | |
FOXR2 | - | - | 9374 | |
LRP5 | - | -1 | 9420 | |
RIPPLY1 | - | - | 9472 | |
EDN1 | - | - | 9540 | |
FOXD4L4 | - | - | 9599 | |
FOXI2 | - | - | 9637 | |
ACD | - | - | 9679 | |
FOXP4 | - | - | 9688 | |
GSC | - | - | 9702 | |
HNF1B | - | -1 | 9881 | |
BBS4 | - | -1 | 10131 | |
FOXC2 | - | - | 10175 | |
FOXA3 | - | - | 10333 | |
TGFBR2 | - | -1 | 10407 | |
SMO | 0.25 | 1 | 10504 | |
HOXB4 | - | - | 10579 | |
LDB1 | - | - | 10693 | |
MAFB | - | - | 10783 | |
GDF3 | - | -1 | 10819 | |
BBS5 | - | -1 | 10945 | |
FOXH1 | - | - | 10963 | |
HES7 | - | -1 | 10974 | |
FOXR1 | - | - | 11124 | |
FOXD4 | - | - | 11635 | |
UNCX | - | - | 11898 | |
CCDC40 | - | - | 11931 | |
FBXL15 | - | - | 12126 | |
TCF7L1 | - | - | 12273 | |
SIX1 | - | -1 | 12393 | |
FOXP3 | - | -1 | 12457 | |
GATA4 | - | -1 | 12466 | |
IFT88 | - | - | 12504 | |
DAND5 | - | - | 12647 | |
HOXB7 | - | - | 12742 | |
MSGN1 | - | - | 12838 | |
PCSK5 | - | - | 13062 | |
HOXB1 | 0.25 | 1 | 13245 | |
FOXB2 | - | - | 13267 | |
WNT9A | - | - | 13365 | |
OOEP | - | - | 13495 | |
MDFI | - | - | 13519 | |
PLXND1 | - | - | 13635 | |
FOXC1 | - | -1 | 13793 | |
MESP1 | - | - | 13805 | |
GJA1 | 0.25 | 1 | 13867 | |
FOXD4L5 | - | - | 13951 | |
FOXO6 | - | - | 14502 | |
MKKS | - | -1 | 14510 | |
NRARP | - | - | 14597 | |
GDF2 | - | - | 14603 | |
INVS | - | -1 | 14708 | |
NTF4 | 0.25 | 1 | 14749 | |
FST | - | - | 14783 | |
NOTO | - | - | 14785 | |
EVX1 | - | - | 15344 | |
WNT5B | - | - | 15534 | |
WLS | - | - | 15707 | |
FOXI3 | - | - | 15933 | |
FEZF1 | 0.25 | 1 | 16009 | |
FOXD4L2 | - | - | 16505 | |
IFT52 | - | - | 16599 | |
PSEN1 | - | - | 18523 | |
SHH | - | -1 | 18571 | |
NOTCH4 | - | - | 19230 | |
HHEX | - | - | 19523 | |
FOXD4L6 | - | - | 19555 | |
DYNC2LI1 | - | - | 19766 | |
MEOX1 | - | - | 20002 | |
FOXS1 | - | - | 20143 | |
HOXB2 | - | - | 20538 | |
POFUT1 | - | - | 20616 | |
TCF15 | - | - | 20798 | |
SOX18 | - | - | 20812 | |
RAB23 | - | - | 20831 | |
OFD1 | - | -1 | 20899 | |
OSR2 | - | - | 20931 | |
KAT2A | - | - | 21262 | |
RPGRIP1L | - | - | 21472 | |
SENP2 | - | - | 21704 | |
WNT4 | - | - | 21809 | |
PLD6 | - | - | 21953 | |
ASPH | - | - | 22018 | |
BBS7 | - | -1 | 22032 | |
TTC8 | - | -1 | 22106 | |
TCAP | - | -1 | 22131 | |
LRP5L | - | - | 22282 | |
TP63 | - | -1 | 22528 | |
IFT172 | - | - | 22658 | |
SETDB2 | 0.25 | 1 | 22691 | |
MESP2 | - | -1 | 22723 | |
DISP1 | - | - | 22983 | |
PSEN2 | - | - | 23095 | |
FZD5 | - | - | 23249 | |
MFNG | - | - | 23605 | |
ENG | - | -1 | 24746 | |
AIDA | - | - | 25211 | |
FOXM1 | - | - | 25656 |
GO:0007389
Name | Description | External IDs |
NEUROD1 | neuronal differentiation 1 | Entrez:4760  HPRD: 03428  HGNC: 7762  Ensembl: ENSG00000162992  |
SATB2 | SATB homeobox 2 | Entrez:23314  Ensembl: ENSG00000119042  HPRD: 12178  HGNC: 21637  |
FGFR2 | fibroblast growth factor receptor 2 | Entrez:2263  HPRD: 01492  Ensembl: ENSG00000066468  HGNC: 3689  |
PLXNA2 | plexin A2 | Entrez:5362  HPRD: 03033  Ensembl: ENSG00000076356  HGNC: 9100  |
APC | adenomatous polyposis coli | Entrez:324  HGNC: 583  HPRD: 01439  Ensembl: ENSG00000134982  |
Geneset | Type | Freq. (Network vs Genome) | P-Value (FDR Corrected) | Genes |
Gene | Description | Avg. edge score to query | Rank | In geneset | In query |
NEUROD1 | neuronal differentiation 1 | ||||
SATB2 | SATB homeobox 2 | ||||
FGFR2 | fibroblast growth factor receptor 2 | ||||
PLXNA2 | plexin A2 | ||||
APC | adenomatous polyposis coli |
Query gene | Gene | Gene description | Edge score |
NEUROD1 | NEUROD1 | neuronal differentiation 1 | |
SATB2 | SATB2 | SATB homeobox 2 | |
FGFR2 | FGFR2 | fibroblast growth factor receptor 2 | |
PLXNA2 | PLXNA2 | plexin A2 | |
APC | APC | adenomatous polyposis coli |