GO:0035239 tube morphogenesis (209)

GeneInput weightStandardRank
SOX11--66
PPP1CA--67
PFN1--74
FGFR2--1165
SFRP1--204
PPP3R1--310
LHX2--362
RET--1384
SALL1--408
MYCN--419
PAX2--459
NR3C1--463
SOX4--581
SLIT2--582
NR4A3--1594
EDA--1615
ZIC3--1722
LRP6--778
PBX1--823
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BMP7--987
HIF1A--1008
SOX9--11045
DLC1--1105
PTCH1--11149
NCOA3--1178
PTHLH--11269
LMO4--1406
AR0.2511499
SMAD3--1541
SEMA5A0.511546
ZIC2--11550
SPRY2--1552
LEF1--1731
FOXA2--1835
TSC10.2511844
CITED1--1867
ESR10.2511914
OPA1--1951
VANGL2--1957
ENAH--1958
NRP1--1961
IGF10.2511993
MAP3K7--2169
NODAL--12184
SRC--2241
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FOXA1--2277
FLT10.2512278
HHIP--2403
BTRC--2430
TFAP2A--12460
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T--2584
SRF--2700
PGR--2715
HAND1--2763
NKX3-1--2779
WNT5A--2870
WNT6--2891
DEAF1--2911
ILK--2917
ALX1--2966
PAX8--13021
WT1--13046
FOXF1--13053
MIB1--3110
COBL0.2513131
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GBX2--3588
DAG1--3662
HAND2--3736
SFRP2--3758
KDR0.2513769
AGT--13783
DDR1--4212
HOXA11--4215
SKI--4231
FGF10--14373
GDNF--14462
WNT11--4528
ZEB2--4607
RGMA--4651
VEGFA0.2514691
IHH--14742
SOX8--4770
WNT3A--4844
CD44--5047
TCF21--5065
GPC3--15153
BMP4--15180
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FOXD1--5256
NTN1--5275
LBX1--5371
BCL2L11--5454
C2CD3--5468
NKX2-50.2515490
FOXD2--5493
CELSR1--5539
HOXD110.2515555
GLI2--15731
IRX2--5779
SMO0.2515864
SDCCAG8--15998
TBX20--16000
IPMK--6074
IFT122--16114
TWIST1--16128
OSR1--6192
CTNNB10.2516229
CTNNBIP1--6252
KIF26B--6333
MED1--6574
TGIF1--16785
HOXA5--7014
CCL11--7037
CXCL12--7204
FOXD4L1--7290
GDF7--7494
PSPN--7530
NPNT--7660
TINAG--7755
EDAR--17761
PGF--7841
VASP--8124
GJA10.2518195
FOXC2--8308
HS2ST1--8389
WNT9B--8495
IRX3--8539
TULP3--8569
KDM2B--8663
EGF0.2518839
PDPN--9029
GLI3--19032
SALL4--9465
NFATC3--9474
BBS5--19517
HNF1B--19562
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RDH10--9600
FGF2--9627
TGFBR2--19756
FOXD4--9835
SUFU--19989
RBM15--10015
GZF1--10434
FOXD4L4--10472
DLG1--10557
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FUZ--10698
ADM--10761
LGR4--10784
MESP1--10948
GATA4--111137
TSC20.25111448
FOXH1--11747
ACVR1--111780
GDF2--11942
NOTCH4--12179
DVL2--12293
PODXL--12778
MKKS--112900
PLXND1--13176
TGM2--13660
MKS1--114639
TGFB10.25114736
SIX1--115117
NRARP--15165
FOXS1--15328
SHH--115942
SOX18--16286
IFT52--16550
FOXD4L5--16935
LRP5--116985
ENG--117647
FOXD4L2--17995
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FOXD4L6--19463
FZD6--19825
VDR--20212
PSEN1--20241
PTK7--20787
CCM2--20854
MYC--121066
B4GALT1--121783
WNT4--21840
IFT172--22164
SETDB20.25122446
CTSZ--22603
KAT2A--22874
CASP8--122936
TP63--124113
TIMELESS--24141
BCL10--124165
BBS7--124350
SCRIB--24455
LIAS--25118
PML--25248

Network

GO:0035239

Network
Enrichment
NameDescriptionExternal IDs
SOX11SRY (sex determining region Y)-box 11 Entrez:6664  HPRD: 02940  HGNC: 11191  Ensembl: ENSG00000176887 
PPP1CAprotein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isozyme Entrez:5499  HGNC: 9281  HPRD: 15942  Ensembl: ENSG00000172531 
PFN1profilin 1 Entrez:5216  HPRD: 01452  HGNC: 8881  Ensembl: ENSG00000108518 
FGFR2fibroblast growth factor receptor 2 Entrez:2263  HGNC: 3689  HPRD: 01492  Ensembl: ENSG00000066468 
SFRP1secreted frizzled-related protein 1 Entrez:6422  HGNC: 10776  HPRD: 09165  Ensembl: ENSG00000104332 
GenesetTypeFreq. (Network vs Genome)P-Value (FDR Corrected)Genes
GeneDescriptionAvg. edge score to queryRankIn genesetIn query
SOX11SRY (sex determining region Y)-box 11
PPP1CAprotein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isozyme
PFN1profilin 1
FGFR2fibroblast growth factor receptor 2
SFRP1secreted frizzled-related protein 1
Query geneGeneGene descriptionEdge score
SOX11SOX11SRY (sex determining region Y)-box 11
PPP1CAPPP1CAprotein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isozyme
PFN1PFN1profilin 1
FGFR2FGFR2fibroblast growth factor receptor 2
SFRP1SFRP1secreted frizzled-related protein 1